La ubicación de las poblaciones con respecto al nivel del mar, influye en el clima, además de la cercanía a las montañas, vientos y la cantidad de bosques nativos.

En las parroquias de Chito y San Andrés, tenemos un microclima templado, con temperaturas que oscilan entre los 14ºC y 20ºC, en relación a su altitud y aún más bajas en la cordillera. En los centros poblados de La Chonta, El Chorro, Zumba, Pucapamba tenemos en promedio temperaturas de 18ºC a 30ºC.

En las partes bajas de Isimanchi, La Balsa y Chito Juntas, las temperaturas sobrepasan los 30ºC. El bosque nublado ha desaparecido, ya poco se observa neblina en el cantón, salvo algunos pocos días del año. Su desaparición ha sido causada por la irracional tala de los bosques, para beneficio de unos pocos, ocasionando al resto de habitantes, presentes y futuros un gran prejuicio para su desarrollo.